這個世界存在著一種被稱為“魔女”的人，她們隱藏自己的力量，在世界上平靜安逸地生活著。 她們有著自己獨特的聯絡方式，偶爾召開一些會議，喝喝茶，賞賞花。 傾聽著地球的聲音，瞭解自然的她們，為了想要融入人類的生活而在世界上團結努力地生活著。                                                                      　　由於長年累月過著人類的平凡生活，現在魔女的子孫們漸漸失去了魔法的力量。 大多數魔女卻非常高興，因為在人間社會要是擁有“特異”的力量會招來什麼樣結果，大家都很清楚。 但是好景不長，平和的日子終於被打破了......                                                                      　　被魔女們稱為聖地的地方籠罩著瘴氣，那其實是增加魔女們魔力的秘密媒介。 生活在人間的魔女們，認為無用的力（魔法）只不過是一種絆腳石罷了，因此將它封印了起來。 但是不知為何封印卻被解開，瘴氣向世界各地擴散著，有著魔女的遺傳子的孩子們的魔力一起覺醒了......                                                                      　　最高幹部的魔女們，決定向各地的小學派遣特使。 將世界各地的還未接觸過魔法的孩子們集中起來，傳授給他們在人間生存以及自衛的法術。 持有魔女的遺傳子的孩子們，被稱為了次世代魔女，即魔法少女。